Build netcdf-3.6.3-intel on ITO Subsystem-A

2021年6月13日更新： WSL2のUbuntu20.04LTSのIntel oneAPI でも動作確認できました．

九州大学スーパーコンピュータITOのサブシステムAにおいて，netcdf-3.6.3 を Intel コンパイラでビルドした備忘録です．netcdf-4.1.2のビルドは こちら にありますように，うまくいきませんでした．

netcdf-3.6.3の入手

2021年6月13日更新： netcdf-3.6.3.tar.gz をダウンロード可能な場所が不明です．
入手していることを前提に進めます．

tar xf netcdf-3.6.3.tar.gz

netcdf-3.6.3 のビルド

ビルド用のスクリプト build_netcdf363.sh を作成します．

#!/bin/bash
# build_netcdf363.sh
export CC=icc
export CXX=icpc
export CFLAGS=-O3
export CXXFLAGS=-O3
export F77=ifort
export FC=ifort
export F90=ifort
export FFLAGS=-O3
export CPP='icc -E'
export CXXCPP='icpc -E'

tar xf netcdf-3.6.3.tar.gz
cd netcdf-3.6.3
./configure --prefix=/home/usr1/account/local/netcdf-3.6.3-intel
make
make check
make install

build_netcdf363.sh に実行権限を付与し，実行します．

chmod a+x build_netcdf363.sh
./build_netcdf363.sh

以上で，完了です．FVCOM 等で利用するときは，以下のように netcdf ライブラリを指定します．

IOLIBS = -L/home/usr1/account/local/netcdf-3.6.3-intel/lib -lnetcdf
IOINCS = -I/home/usr1/account/local/netcdf-3.6.3-intel/include