Windows版GMT-5をWSL (Ubuntu)のbashから呼ぶ方法

Windows版のGMT-5（最新版はGMT-5.4.2）はダブルクリックで簡単にインストールすることができます．WSL (Ubuntu 16.04)ではGMT-5.4.2のBuildがうまくいかず（後に成功しました．こちらの記事参照），aptで入るGMT-5.2.1を使っていますが（こちらの記事参照），Windows版でしたら，最新版を難なく利用可能です．一方，Windowsコマンドプロンプトのスクリプトはbashのスクリプトと互換性がなく，bashの方が情報量や機能面で圧倒的に勝っていると思われます．Windows 10ではWSLという画期的な機能が追加されました．この機能の一つに「bashからWindowsの実行形式が実行可能」というものがあります．ただし，この場合は拡張子exeが省略できません（拡張子exeの有無でWindowsかLinuxかを判定しているものと思われます）．これを使えば，WSLのbash scriptでWindows版のGMTが呼び出し可能となります．

コマンドgmtを使い分ける

Linux版のGMTのコマンドは
[cc]
$ gmt pscoast
[/cc]
のように，gmtを付けて呼ぶことができます．Windows版でも同様ですが，WSLのbashでは拡張子exeが省略できないので，
[cc]
$ gmt.exe pscoast
[/cc]
のように呼びます．ただし，pscoastの方には拡張子exeを付けません．
よって，変数$gmtをWindows版とLinux版でそれぞれgmtおよびgmt.exeに設定すればよいことになります．

フォルダ（ディレクトリ）構造の違いを吸収する

WSLを利用する場合も，基本的にWindowsのフォルダで作業することを想定しますと，WSLとWindowsでフォルダ（ディレクトリ）構造が異なることに注意が必要です．例えば，WindowsのCドライブはWSLでは「/mnt/c」にマウントされます．一方，Windows版のGMTはWindowsのフォルダ構造のまま理解しますので，CドライブはCドライブのままで，これをbashから利用できるようにするには，「c:」とする（最初の/なし，コロンが必要）必要があります．

bashスクリプトの例

以上に留意すると，bash scriptで以下のようにすれば実現できます．
[cc]
gmt_system=linux # デフォルトはLinux版としておきます
### コマンドライン第1引数がwindowsの場合にWindows版を利用するよう設定します
if [ "$1" = "windows" ] ; then
gmt_system=windows ; shift
fi
if [ "${gmt_system}" = "windows" ] ; then # Windows版を利用する場合
c_dir="c:" # Windows版を利用するときのCドライブのpathをc_dirに入れます
gmt="gmt.exe" # Windows版を利用するときは拡張子exeが必要です
echo -n Windows GMT-; $(echo $gmt --version) # Windows版であることを表示します
else # Linux版を利用する場合
c_dir="/mnt/c" # Linux版を利用するときのCドライブのpathをc_dirに入れます
gmt="gmt" # Linux版ではgmtに拡張子を付けません
echo -n Linux GMT-; $(echo $gmt --version) # Linux版であることを表示します
fi
### 以降はWindows版かLinux版かを気にすることなく，bash scriptを書いていきます
### psxyを呼ぶ例です．変数rxy，proj，polygon，psが別途定義済みと仮定しています
$gmt psxy ${c_dir}/dat/data.xyz -R${rxy} -J${proj} -G${polygon} -P -K >${ps}
．．．
[/cc]
これまではVMware上でLinuxをインストールし，GMTを利用していましたが，WSLを利用する場合はbashの窓が瞬時に開くため，ストレス無く，Windowsネイティブの機能であるかのように使えます．革命的です．