東大スパコンHA8000のおけるWRF V3のserialにおける実行方法についてまとめます．WRF提供のidealized caseのem_b_waveをserialでコンパイル済みと仮定します．ログインノードでの実行もできますが，ここではセンター標準のバッチジョブで実行します．

ジョブスクリプトの作成

ジョブスクリプトを作成します．ファイル名はrun_test.cshとし，executableの属性を付与します．以下が例ですが，#@$-を除いて#以降はコメントで，(*)はオプショナルです．ジョブスクリプトはホームディレクトリ基準ですので，実行ファイルのあるディレクトリまで移動する必要があります．

#!/bin/bash
#@$-q debug  # ジョブを投入するキュー（パイプキュー）を指定
#@$-N 1        # 利用ノード数（シングルなので，1）
#@$-J T4     # ノード当たりのプロセス数
#@$-lT 00:05:00  # 予想実行時間（時：分：秒）
#@$-lM 4GB       # メモリサイズ(*)
#@$-e fout.e        # 標準エラー出力ファイル名(*)
#@$-o fout.o        # 標準出力ファイル名(*)
#@$-lc 0MB        # コアファイルサイズ(*)
#@$-ls 192MB    # プロセスごとのスタックサイズ(*)
#@$-lm 2GB        # プロセスごとのメモリサイズ(*)

##export WRF_EM_CORE=1 #Required only for compiling

cd WRF/WRFV3/run    # ~/を基準としてディレクトリ移動
./ideal.exe
./wrf.exe
date

ノード当たりのプロセス数がよくわからなかったので，1，4，16の3通りで試したところ，実行速度の差は小さく，速度の速い順に4>1>16という結果になりました．ということで，-J T4 としておけばよいのではないでしょうか．

改めてコンパイルする際には，WRFV3/において次のコマンドで不要ファイルを削除しましょう．

• ./clean -a