Thunderbird3以降から,使い続けていると動作が非常に遅くなる現象が見られます.特に,メールをフォルダに移動するのにすごく時間がかかるようになりました.
%APPDATA%\Thunderbird\Profiles\にある,global-messages-db.sqliteが巨大になっていることが原因の場合はこのファイルを削除すれば軽快になります.私のは700MBを超えていました.さらに,ツール⇒オプション⇒詳細の高度な設定で,「グローバル検索と索引データベースを有効にする」のチェックボックスを外します.詳細はこちらに説明があります.

しかし問題が・・・

しかしながら,当たり前なのですが,グローバル検索ができなくなってしまいました.その方が深刻なので,結局元に戻しました.よって,未解決です.